
Analyse combinée de l'expression de la protéine MGMT (O6-Methylguanine ADN methyltransferase) et de la méthylation du promoteur pour un pronostic optimisé des glioblastomes
Actualité 418 du 21/01/2013
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Article original Neuro Oncol. 2013 le 17 janvier.
Analyse combinée de l'expression de la protéine MGMT (O6-Methylguanine ADN methyltransferase) et de la méthylation du promoteur pour un pronostic optimisé des pronostics d'un glioblastome.
Auteurs :
Lalezari S, Chou AP, Tran UN, Solis OE, Khanlou N, Chen W, Li S, Carrillo JA, Chowdhury R, Selfridge J, Sanchez DE, Wilson RW, M Zurayk, Lalezari J, Lou JJ, Ormiston L, K Ancheta, Hanna R, Miller P, Piccioni D, Ellingson BM, Buchanan C, Mischel PS, Nghiemphu PL, Green R, Wang HJ, Pape WB, Liau LM, Elashoff RM, Cloughesy TF, Yong WH, Lai A., Département de Neurologie (S.L., A.T., W.C., S.L., R.C., J.S., M.Z., J.L., J.J.L., L.O., K.A., R.H., DE L'APRÈS-MIDI, D.P., P.L.N., T.F.C., A.L.), Département de Neurochirurgie (A.P.C., C.B., L.M.L.), et Département de Pathologie, David Geffen School de Médecine à UCLA, Université de Californie, Los Angeles, Californie (O.E.S., N.K., D.E.S., R.W.W. P.S.M. W.H.Y.); Département de Neurologie, UC Irvine École de Médecine, Université de Californie, Irvine, Californie (J.A.C.); Département de Sciences Radiologiques, David Geffen School de Médecine à UCLA, Université de Californie, Los Angeles, Californie (B.M.E., W.B.P.); Kaiser Permanente Californie Du sud (R.G.); et Département de Biomathematics, David Geffen School de Médecine à UCLA, Université de Californie, Los Angeles, Californie.
Résumé :
La méthylation du promoteur du gène de réparation MGMT ( O 6 Méthylguanine-ADN méthyltransférase, est associé avec des résultats améliorés dans les traitements du glioblastome récemment diagnostiqué (GBM) traité avec la radio-chimiothérapie de Temodal standard. Pour déterminer la signification pronostique de l'expression de la protéine MGMT comme mesuré par immunohistochimie (IHC) et son rapport avec la méthylation du promoteur, nous avons analysé l'expression de la protéine MGMT et la méthylation du promoteur dans la survie sur une cohorte de malades.
Methodes :
Rétrospectivement, notre étude a porté sur 418 malades avec glioblastome GBM récemment diagnostiqué à Université de Californie, Los Angeles Kaiser Permanente Los Angeles. Presque tous avaient reçu la radio-chimiothérapie, la détermination de la protéine MGMT par IHC, et l'analyse de la méthylation du promoteur par méthylation-spécifique PCR (MSP) et séquencage bisulfite (BiSEQ) de 24 sites CpG voisins.
Resultats :
Avec un pourcentage médian des cellules colorées par IHC comme un seuil, les malades avec moins de 30% de coloration avait une survie sans progression de 10,9 mois et survie totale (OS) de 20,5 mois, comparativement à la survie sans progression de 7,8 mois et une survie totale OS de 16.7 mois chez les malades avec plus de 30% de coloration. Enterrez - et la corrélation de l'intrareader d'IHC tacher était haute. Le statut du méthylation du promoteur par MSP a correspondu avec la coloration IHC. Cependant, une coloration basse par IHC a fréquemment été observée en l'absence de méthylation du promoteur. La densité de méthylation augmentée déterminée par BiSEQ a correspondu avec une diminution de la coloration IHC et une une augmentation de la survie, en fournissant ainsi une alternative semiquantitative pratique à MSP. D'après l'analyse multifactorielle validée, les malades avec méthylation du promoteur et expression basse de la coloration IHC ont montré une amélioration de la survie totale OS et de la survie sans progression, comparé aux autres combinaisons.
Conclusions :
L'estimation optimale du statut de méthylation de MGMT comme biomarqueur pronostique pour les malades avec glioblastome GBM récemment diagnostiqué traité avec radiochimiothérapie exige la détermination conjointe de la méthylation du promoteur et de l'expression de la protéine par IHC.
Pubmed : 23328811
Vocabulaire :
IHC :
L'IHC pour immunohistochimie (de immuno, anticorps et histo, tissu) est une technique consistant à utiliser des anticorps pour viser des antigènes et augmenter la visualisation des cellules par des couleurs fluorescente en général. Ce type d’analyse utilise des principes et des techniques d’immunologie pour la révélation d’antigènes par des anticorps marqués par des enzymes qui produisent un changement de coloration à l’emplacement de l’épitope d’intérêt sur des coupes de tissu.
PCR MSP :
Amplification en chaîne par polymérisation spéfique ou réaction en chaîne par polymérisation (PCR est l'abréviation anglaise de polymerase chain reaction, l'acronyme français ACP pour amplification en chaîne par polymérase est très rarement employé), est une méthode de biologie moléculaire d'amplification génique in vitro, qui permet de dupliquer en grand nombre (avec un facteur de multiplication de l'ordre du milliard), une séquence d'ADN ou d'ARN connue, à partir d'une faible quantité (de l'ordre de quelques picogrammes) d'acide nucléique (séquence spécifiqued’ADN (l’Amplicon) ou amorces spécifiques constituées d'oligonucléotides de synthèse de 20 à 25 nucléotides). On peut ainsi, par exemple, détecter la présence du virus VIH (et non du SIDA selon l'inventeur de la PCR, le Prix Nobel Kary Mullis) ou de mesurer une charge virale (concentration du virus dans le plasma), des traces d'OGM (organismes génétiquement modifiés), ou encore des virus d'hépatites B, C et D.Analyse par puce ou analyse moléculaire qui permet de comparer le ou les gènes d'une cellule à un échantillon sain.
Séquençage bisulfite ou bisulfite de séquençage : Processus biologique consistant à utiliser du bisulfite dans le traitement de l'ADN pour déterminer son profil de méthylation. La méthylation est l'addition d'un groupe méthyle CH3, à la position de carbone-5 de la cytosine du nucléotide CpG, qui entraine une répression de l'activité transcriptionnelle dans la formation des protéines. En présence du bisulfite, il se produit une désamination des Cytosines en Uracile. Cependant, cette désamination est beaucoup plus rapide quand les Cytosines sont déméthylées que quand elles sont méthylées. En pratique, seules les Cytosines déméthylées seront transformées.
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